D-FM-20-BIFV - Bioinformatika u istraživanjima fitopatogenih virusa
Specifikacija predmeta | ||||
---|---|---|---|---|
Naziv | Bioinformatika u istraživanjima fitopatogenih virusa | |||
Akronim | D-FM-20-BIFV | |||
Studijski program | Poljoprivredne nauke | |||
Modul | Fitomedicina | |||
Tip studija | doktorske akademske studije | |||
Nastavnik (predavač) | ||||
Nastavnik/saradnik (vežbe) | ||||
Nastavnik/saradnik (DON) | ||||
Broj ESPB | 10.0 | Status predmeta | izborni | |
Uslovljnost drugim predmetima | nema | Oblik uslovljenosti | ||
Ciljevi izučavanja predmeta | Primena informacionih tehnologija u karakterizaciji molekularnih komponenti biljnih virusa. Poznavanje računarskih programa za analizu bioloških podataka i informacija aminokiselinskih i nukleotidnih sekvenci biljnih virusa. Rešavanje bioloških problema vezanih za biljne viruse korišćenjem RNK, DNK i aminokiselinskih sekvenci i srodnih informacija. | |||
Ishodi učenja (stečena znanja) | Od studenta se očekuje da ovlada računarskom analizom bioloških podataka: pronalaženjem, preuizmanjem, čuvanjem, organizacijom, arhiviranjem, analizom i vizuelizacijom bioloških, pre svega genetičkih informacija biljnih virusa. | |||
Sadržaj predmeta | ||||
Sadržaj teorijske nastave | Taksonomija i klasifikacija biljnih virusa. Povezanost genoma i proteinskih komponenti virusa, srodnost genoma biljnih virusa. Varijabilnost virusa. Vrsta, soj, haplotipovi. Deponovanje sekvenci u baze podataka. Analiza podataka korišćenjem različitih algoritama. Testovi razlikovanja populacije,testovi identifikacije selekcionog pritiska, testovi rekombinacije. | |||
Sadržaj praktične nastave | Korišćenje računara u obradi bioloških informacija biljnih virusa. Interpretacija rezultata dobijenih na osnovu analiza korišćenjem programa informacione tehnologije. | |||
Literatura | ||||
| ||||
Broj časova aktivne nastave nedeljno tokom semestra/trimestra/godine | ||||
Predavanja | Vežbe | DON | Studijski i istraživački rad | Ostali časovi |
6 | 0 | 2 | ||
Metode izvođenja nastave | Teorijska interaktivna nastava. Izrada seminarskog rada iz jedne od predviđenih oblasti. Grupni projekt: primena kompjuterskih programa za analizu amino i nukleotidnih sekvenci odabranog virusa kao model sistem. | |||
Ocena znanja (maksimalni broj poena 100) | ||||
Predispitne obaveze | Poena | Završni ispit | Poena | |
Aktivnosti u toku predavanja | 5 | Pismeni ispit | ||
Praktična nastava | 5 | Usmeni ispit | 40 | |
Projekti | 20 | |||
Kolokvijumi | 10 | |||
Seminari | 20 |